Agustín Almendra fue una aparición de las inferiores de Boca y en la Primera División Xeneize disputó 69 partidos, logrando 6 goles desde su debut en 2018. Su conflicto con el actual entrenador Sebastián Battaglia lo margino del primer equipo y ahora no tendría posibilidades de regresar.
En diálogo con ESPN, el DT confesó que la decisión «no me costó» y aseguró que se mantiene firme: «Creo en lo que hago, tengo cosas claras y a partir de ahí no me cuesta nada. Saber lo que uno piensa. A partir de ahí no me cuesta nada. Ha tenido un momento en que las consecuencias las tiene que pagar como en este caso. Soy claro en lo que pienso y no hablé más con él».
El último partido de Almendra con la camiseta de Boca fue el 20 de febrero por la Copa de la Liga, cuando ingresó apenas 8 minutos en el triunfo 2-1 ante Rosario Central en cancha de Vélez.
